對水進行紫外線消毒，是對水進行紫外線照射。紫外線根據波長的長短分為三個部分。A波段是三百二十納米到四百納米，B波段二百七十五納米到三百二十納米，C波段二百納米到二百七十五納米，對水進行紫外線消毒使用C波段的紫外線。
光量子的理論認為，光以一種特殊的形式運動，光是不斷連續的粒子流。紫外線照射到物體上面的時候，能夠傳遞能量，然后慢慢的積累，就會將微生物殺手，從而達到消毒的作用。
紫外線對飲用水的實際應用中，消毒器的構造、水流的分布在消毒的過程中輻射強度的變化、電源的特征等，消毒器內部紫外線強度以及提供的輻射應該有余量。